El fútsal hace su ingreso a la Liga Rionegrina de Fútbol en 2009, con la realización de un torneo piloto, a instancias del dirigente Guillermo Beacon y con el profesor Nicolás Chirico como referente de la organización.
La formación de "Compadres" fue la primera en gritar campeón.
Desde 2010 a 2019, Beacon y diferentes colaboradores llevaron adelante la actividad, con un crecimiento constante en logística y en equipos participantes.
Por ejemplo, en 2017 hace su ingreso el fútsal femenino a la actividad federada. Un año después, se suman categorías formativas y veteranos.
Diferentes equipos masculinos de la Comarca fueron a más de diez nacionales, enfrentando a formaciones reconocidas como River, Boca y Pinocho, entre otras. En la rama femenina, Maragatas participó del primer torneo nacional que en 2019 tuvo lugar en San Juan.
Además, unos 30 equipos tuvieron la oportunidad de disputar torneos patagónicos.
A partir de 2020 hay un recambio dirigencial, que deja a María Nazarena Fuentes como titular del Departamento de Fútsal, acompañada por Adrián Pérez, Facundo Petrone, Adrián Blanch y Carlos Salicioni.
